##FastQC 0.11.5 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename SRR1780653_2.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 30 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 50 %GC 60 >>END_MODULE >>Per base sequence quality pass #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 28.266666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 2 27.4 NaN NaN NaN NaN NaN 3 27.066666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 4 30.8 NaN NaN NaN NaN NaN 5 30.633333333333333 NaN NaN NaN NaN NaN 6 32.53333333333333 NaN NaN NaN NaN NaN 7 30.0 NaN NaN NaN NaN NaN 8 30.8 NaN NaN NaN NaN NaN 9 33.6 NaN NaN NaN NaN NaN 10 33.56666666666667 NaN NaN NaN NaN NaN 11 31.533333333333335 NaN NaN NaN NaN NaN 12 32.333333333333336 NaN NaN NaN NaN NaN 13 33.43333333333333 NaN NaN NaN NaN NaN 14 34.9 NaN NaN NaN NaN NaN 15 33.7 NaN NaN NaN NaN NaN 16 34.266666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 17 34.8 NaN NaN NaN NaN NaN 18 31.366666666666667 NaN NaN NaN NaN NaN 19 32.93333333333333 NaN NaN NaN NaN NaN 20 30.966666666666665 NaN NaN NaN NaN NaN 21 32.5 NaN NaN NaN NaN NaN 22 33.166666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 23 32.666666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 24 31.266666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 25 32.56666666666667 NaN NaN NaN NaN NaN 26 32.166666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 27 29.933333333333334 NaN NaN NaN NaN NaN 28 30.333333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 29 30.766666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 30 30.366666666666667 NaN NaN NaN NaN NaN 31 30.466666666666665 NaN NaN NaN NaN NaN 32 30.2 NaN NaN NaN NaN NaN 33 30.266666666666666 NaN NaN NaN NaN NaN 34 28.833333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 35 30.0 NaN NaN NaN NaN NaN 36 29.666666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 37 28.8 NaN NaN NaN NaN NaN 38 29.4 NaN NaN NaN NaN NaN 39 29.833333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 40 30.1 NaN NaN NaN NaN NaN 41 28.7 NaN NaN NaN NaN NaN 42 29.866666666666667 NaN NaN NaN NaN NaN 43 29.433333333333334 NaN NaN NaN NaN NaN 44 27.966666666666665 NaN NaN NaN NaN NaN 45 27.333333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 46 28.2 NaN NaN NaN NaN NaN 47 27.733333333333334 NaN NaN NaN NaN NaN 48 26.4 NaN NaN NaN NaN NaN 49 27.7 NaN NaN NaN NaN NaN 50 27.8 NaN NaN NaN NaN NaN >>END_MODULE >>Per tile sequence quality fail #Tile Base Mean 1211 1 14.666666666666668 1211 2 11.666666666666668 1211 3 15.666666666666668 1211 4 20.0 1211 5 16.666666666666668 1211 6 7.0 1211 7 19.666666666666668 1211 8 16.666666666666668 1211 9 13.333333333333332 1211 10 19.333333333333332 1211 11 16.0 1211 12 21.0 1211 13 11.333333333333332 1211 14 15.666666666666668 1211 15 19.333333333333332 1211 16 14.0 1211 17 22.333333333333332 1211 18 18.666666666666668 1211 19 15.666666666666668 1211 20 19.0 1211 21 16.666666666666668 1211 22 12.333333333333332 1211 23 8.666666666666668 1211 24 19.333333333333332 1211 25 17.333333333333332 1211 26 16.666666666666668 1211 27 22.0 1211 28 16.666666666666668 1211 29 13.0 1211 30 18.0 1211 31 17.666666666666668 1211 32 14.333333333333332 1211 33 20.0 1211 34 18.333333333333332 1211 35 11.666666666666668 1211 36 16.666666666666668 1211 37 11.333333333333332 1211 38 5.333333333333332 1211 39 11.333333333333332 1211 40 9.0 1211 41 8.666666666666668 1211 42 10.333333333333332 1211 43 12.0 1211 44 14.333333333333332 1211 45 10.333333333333332 1211 46 8.666666666666668 1211 47 13.666666666666668 1211 48 14.666666666666668 1211 49 10.0 1211 50 19.0 2202 1 -3.333333333333332 2202 2 2.666666666666668 2202 3 -10.333333333333332 2202 4 -10.0 2202 5 -13.333333333333332 2202 6 -3.0 2202 7 -9.333333333333332 2202 8 -3.333333333333332 2202 9 -2.666666666666668 2202 10 -11.666666666666668 2202 11 -2.0 2202 12 -10.0 2202 13 -0.6666666666666679 2202 14 -16.333333333333332 2202 15 -6.666666666666668 2202 16 -2.0 2202 17 -11.666666666666668 2202 18 -14.333333333333332 2202 19 -5.333333333333332 2202 20 -10.0 2202 21 -3.333333333333332 2202 22 -1.6666666666666679 2202 23 5.666666666666668 2202 24 -9.666666666666668 2202 25 -8.666666666666668 2202 26 -5.333333333333332 2202 27 -11.0 2202 28 0.6666666666666679 2202 29 0.0 2202 30 -13.0 2202 31 -12.333333333333332 2202 32 -8.666666666666668 2202 33 -12.0 2202 34 -3.666666666666668 2202 35 -4.333333333333332 2202 36 -2.333333333333332 2202 37 2.333333333333332 2202 38 0.33333333333333215 2202 39 -15.666666666666668 2202 40 -2.0 2202 41 2.666666666666668 2202 42 5.333333333333332 2202 43 2.0 2202 44 -2.666666666666668 2202 45 3.333333333333332 2202 46 -6.333333333333332 2202 47 -6.333333333333332 2202 48 -12.333333333333332 2202 49 0.0 2202 50 -8.0 2212 1 -11.333333333333332 2212 2 -14.333333333333332 2212 3 -5.333333333333332 2212 4 -10.0 2212 5 -3.333333333333332 2212 6 -4.0 2212 7 -10.333333333333332 2212 8 -13.333333333333332 2212 9 -10.666666666666668 2212 10 -7.666666666666668 2212 11 -14.0 2212 12 -11.0 2212 13 -10.666666666666668 2212 14 0.6666666666666679 2212 15 -12.666666666666668 2212 16 -12.0 2212 17 -10.666666666666668 2212 18 -4.333333333333332 2212 19 -10.333333333333332 2212 20 -9.0 2212 21 -13.333333333333332 2212 22 -10.666666666666668 2212 23 -14.333333333333332 2212 24 -9.666666666666668 2212 25 -8.666666666666668 2212 26 -11.333333333333332 2212 27 -11.0 2212 28 -17.333333333333332 2212 29 -13.0 2212 30 -5.0 2212 31 -5.333333333333332 2212 32 -5.666666666666668 2212 33 -8.0 2212 34 -14.666666666666668 2212 35 -7.333333333333332 2212 36 -14.333333333333332 2212 37 -13.666666666666668 2212 38 -5.666666666666668 2212 39 4.333333333333332 2212 40 -7.0 2212 41 -11.333333333333332 2212 42 -15.666666666666668 2212 43 -14.0 2212 44 -11.666666666666668 2212 45 -13.666666666666668 2212 46 -2.333333333333332 2212 47 -7.333333333333332 2212 48 -2.333333333333332 2212 49 -10.0 2212 50 -11.0 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 10 1.0 11 0.0 12 1.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 2.0 17 0.0 18 1.0 19 2.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 1.0 24 0.0 25 2.0 26 1.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 2.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 1.0 35 0.0 36 4.0 37 3.0 38 6.0 39 3.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 50.0 16.666666666666664 16.666666666666664 16.666666666666664 2 16.666666666666664 23.333333333333332 26.666666666666668 33.33333333333333 3 26.666666666666668 3.3333333333333335 26.666666666666668 43.333333333333336 4 23.333333333333332 16.666666666666664 20.0 40.0 5 30.0 26.666666666666668 20.0 23.333333333333332 6 53.333333333333336 20.0 16.666666666666664 10.0 7 30.0 16.666666666666664 20.0 33.33333333333333 8 30.0 33.33333333333333 20.0 16.666666666666664 9 36.666666666666664 6.666666666666667 20.0 36.666666666666664 10 26.666666666666668 30.0 10.0 33.33333333333333 11 43.333333333333336 10.0 16.666666666666664 30.0 12 33.33333333333333 13.333333333333334 16.666666666666664 36.666666666666664 13 36.666666666666664 10.0 23.333333333333332 30.0 14 30.0 10.0 13.333333333333334 46.666666666666664 15 33.33333333333333 23.333333333333332 10.0 33.33333333333333 16 43.333333333333336 23.333333333333332 13.333333333333334 20.0 17 36.666666666666664 13.333333333333334 23.333333333333332 26.666666666666668 18 30.0 13.333333333333334 26.666666666666668 30.0 19 36.666666666666664 13.333333333333334 30.0 20.0 20 23.333333333333332 33.33333333333333 13.333333333333334 30.0 21 33.33333333333333 13.333333333333334 16.666666666666664 36.666666666666664 22 20.0 16.666666666666664 30.0 33.33333333333333 23 30.0 23.333333333333332 23.333333333333332 23.333333333333332 24 33.33333333333333 16.666666666666664 23.333333333333332 26.666666666666668 25 33.33333333333333 20.0 13.333333333333334 33.33333333333333 26 33.33333333333333 20.0 16.666666666666664 30.0 27 33.33333333333333 26.666666666666668 16.666666666666664 23.333333333333332 28 30.0 33.33333333333333 13.333333333333334 23.333333333333332 29 30.0 10.0 23.333333333333332 36.666666666666664 30 30.0 20.0 26.666666666666668 23.333333333333332 31 36.666666666666664 10.0 26.666666666666668 26.666666666666668 32 33.33333333333333 23.333333333333332 16.666666666666664 26.666666666666668 33 30.0 10.0 26.666666666666668 33.33333333333333 34 53.333333333333336 16.666666666666664 23.333333333333332 6.666666666666667 35 36.666666666666664 16.666666666666664 20.0 26.666666666666668 36 33.33333333333333 13.333333333333334 23.333333333333332 30.0 37 30.0 23.333333333333332 20.0 26.666666666666668 38 43.333333333333336 10.0 30.0 16.666666666666664 39 40.0 26.666666666666668 13.333333333333334 20.0 40 26.666666666666668 33.33333333333333 16.666666666666664 23.333333333333332 41 33.33333333333333 16.666666666666664 26.666666666666668 23.333333333333332 42 26.666666666666668 16.666666666666664 16.666666666666664 40.0 43 23.333333333333332 16.666666666666664 33.33333333333333 26.666666666666668 44 26.666666666666668 20.0 20.0 33.33333333333333 45 23.333333333333332 10.0 26.666666666666668 40.0 46 23.333333333333332 33.33333333333333 20.0 23.333333333333332 47 30.0 23.333333333333332 23.333333333333332 23.333333333333332 48 23.333333333333332 26.666666666666668 13.333333333333334 36.666666666666664 49 16.666666666666664 23.333333333333332 20.0 40.0 50 23.333333333333332 16.666666666666664 33.33333333333333 26.666666666666668 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 1.0 34 2.0 35 1.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.5 40 1.0 41 1.0 42 1.0 43 1.5 44 2.0 45 1.0 46 0.0 47 1.0 48 2.0 49 2.5 50 3.0 51 1.5 52 0.0 53 2.0 54 4.0 55 2.0 56 0.0 57 0.0 58 0.0 59 0.5 60 1.0 61 1.0 62 1.0 63 0.5 64 0.0 65 0.0 66 0.0 67 0.0 68 0.0 69 1.5 70 3.0 71 2.0 72 1.0 73 1.5 74 2.0 75 1.0 76 0.0 77 2.5 78 5.0 79 3.0 80 1.0 81 0.5 82 0.0 83 0.0 84 0.0 85 0.0 86 0.0 87 0.0 88 0.0 89 0.5 90 1.0 91 0.5 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 50 30.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source ACCTATCACACCCCATCCTAAAGTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGTGC 1 3.3333333333333335 No Hit GTTACTACGAGGGCTATGTGGCTGATTGAAGAGTATGCAATGAGCGATTT 1 3.3333333333333335 No Hit GAGCCGGTGGCCTGGTCCTAATGGCACGCCGGCGCCGGCACCCACCGCCG 1 3.3333333333333335 No Hit GTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAAT 1 3.3333333333333335 No Hit GATGCTGAGACCGGCATGGGATATGGAAGGGCTCCAGAGGTTTCCACAAT 1 3.3333333333333335 No Hit GTCGACGACGACGCCGGACCGGGAACGCCTCTCGGCGGAAAGCCGCTCGC 1 3.3333333333333335 No Hit CCCCGGGGCGAGGCGGTCCCCTATCGGGGTCCCTGTGTGCGGGGCAGGGT 1 3.3333333333333335 No Hit CACCATTTCCGACGGCATCTACGGCTCAACATTTTTTGTAGCCACAGGCT 1 3.3333333333333335 No Hit CTCCGGGATCCACCACAGGCGGAACAGCCCCAGGACTGTCTCTTATACAC 1 3.3333333333333335 No Hit AGTATAAATAGTACCGGTAACTTCCAGTTATCTAGTTTGGACTACATTCA 1 3.3333333333333335 No Hit GGGGTGGGGCCTTCTATGGCTGAGGGGAGTCAGGGGTGGAGACCTAATTC 1 3.3333333333333335 No Hit TTCCAGCGCCGCGTCGAGTTCCCGGTCGACGCCCTGCGCACGTACCGGAC 1 3.3333333333333335 No Hit GACGTGCCCACCTTCTGGTCCCACGCCCTGCAGGGCGTCTCCGGTGCGCG 1 3.3333333333333335 No Hit GTGTGATAGTTGAGGGTTGATTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGAGG 1 3.3333333333333335 No Hit TGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATTTTATT 1 3.3333333333333335 No Hit ACGCCGCCGACGCCGCTCACGCGGGGCGCGCGCTCCCGCGTCTGTCTCTT 1 3.3333333333333335 No Hit GCTATGCGTTTTGTCAGGGGGTTGAGAATGGGTGTGAGGCGTATTATACC 1 3.3333333333333335 No Hit ACATAAACTGTGGGGGGTGTCTTTGGGGTTTGGTTGGTTCGGGGTATGGG 1 3.3333333333333335 No Hit GGCGGCGGCCCCTCCCCCTGCCCCCGCGGGGACGCCGGGGGCGCGGACAG 1 3.3333333333333335 No Hit GTGCCGCACGTGGCCACCGCCGTCCCGACACCGGCCAGGTGGGCCGCCAT 1 3.3333333333333335 No Hit CCGAGGGGACGGGCGCCGAAGCCTTCTCCCGATAGAACGAGCACGTGGCG 1 3.3333333333333335 No Hit GACACACAGCCCTGACCAACCGCCGCCGCAGAAGCCAGCAACGCCTCCCG 1 3.3333333333333335 No Hit TCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTAAAGTGATCCTT 1 3.3333333333333335 No Hit CCGCCGTGCGGCCCGGTCCGGACGGCTCGCTGGAGCCTGTCTCTTATACA 1 3.3333333333333335 No Hit ACCCAACACAGGCATGCTCATAAGGAAAGGTTAAAAACAGTAAAAGGCAC 1 3.3333333333333335 No Hit GGTGACATGATTTTCTCCGAGCTTCCGACATGCGAGACACTCCCCCAACA 1 3.3333333333333335 No Hit TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTC 1 3.3333333333333335 No Hit GACGTGCTCGATGAAAGGGCGTGGTCATCTTTGGGTCGTCAATTGAAACA 1 3.3333333333333335 No Hit TCCCGACGGCGCGGCGGTCACCTACCGCGTGCTGCGCCCGCTGGCGCGCA 1 3.3333333333333335 No Hit GATCGTGCACGGCCAGATGACGGCGGTCGGGGGGCGGGGCCTCCCCCCCT 1 3.3333333333333335 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content warn #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA 3' Adapter Illumina Small RNA 5' Adapter Nextera Transposase Sequence SOLID Small RNA Adapter 1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 36 0.0 0.0 0.0 3.3333333333333335 0.0 37 0.0 0.0 0.0 6.666666666666667 0.0 38 0.0 0.0 0.0 6.666666666666667 0.0 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE