##FastQC 0.11.5 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename SRR1780551_2.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 36 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 50 %GC 61 >>END_MODULE >>Per base sequence quality pass #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 28.0 NaN NaN NaN NaN NaN 2 28.083333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 3 27.666666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 4 29.75 NaN NaN NaN NaN NaN 5 30.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 6 30.833333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 7 30.833333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 8 31.166666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 9 32.138888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 10 31.694444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 11 30.694444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 12 30.916666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 13 31.194444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 14 32.416666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 15 32.19444444444444 NaN NaN NaN NaN NaN 16 32.80555555555556 NaN NaN NaN NaN NaN 17 34.44444444444444 NaN NaN NaN NaN NaN 18 32.97222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 19 32.861111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 20 29.61111111111111 NaN NaN NaN NaN NaN 21 31.75 NaN NaN NaN NaN NaN 22 31.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 23 32.083333333333336 NaN NaN NaN NaN NaN 24 31.47222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 25 31.333333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 26 32.888888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 27 30.916666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 28 30.916666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 29 28.194444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 30 30.27777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 31 29.75 NaN NaN NaN NaN NaN 32 29.86111111111111 NaN NaN NaN NaN NaN 33 29.444444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 34 29.194444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 35 28.0 NaN NaN NaN NaN NaN 36 28.22222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 37 27.305555555555557 NaN NaN NaN NaN NaN 38 26.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 39 28.97222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 40 27.805555555555557 NaN NaN NaN NaN NaN 41 27.694444444444443 NaN NaN NaN NaN NaN 42 25.555555555555557 NaN NaN NaN NaN NaN 43 27.583333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 44 28.305555555555557 NaN NaN NaN NaN NaN 45 27.63888888888889 NaN NaN NaN NaN NaN 46 29.13888888888889 NaN NaN NaN NaN NaN 47 28.083333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN 48 26.416666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 49 27.166666666666668 NaN NaN NaN NaN NaN 50 27.083333333333332 NaN NaN NaN NaN NaN >>END_MODULE >>Per tile sequence quality fail #Tile Base Mean 1204 1 4.666666666666668 1204 2 2.0 1204 3 6.333333333333332 1204 4 6.666666666666668 1204 5 2.666666666666668 1204 6 -7.333333333333332 1204 7 6.666666666666668 1204 8 6.666666666666668 1204 9 5.666666666666668 1204 10 8.0 1204 11 8.0 1204 12 -1.3333333333333321 1204 13 7.333333333333332 1204 14 9.333333333333332 1204 15 3.333333333333332 1204 16 8.666666666666668 1204 17 10.0 1204 18 10.666666666666668 1204 19 9.666666666666668 1204 20 8.0 1204 21 9.666666666666668 1204 22 5.0 1204 23 8.666666666666668 1204 24 0.33333333333333215 1204 25 0.6666666666666679 1204 26 -1.6666666666666643 1204 27 5.0 1204 28 8.333333333333332 1204 29 1.0 1204 30 -10.0 1204 31 -10.666666666666668 1204 32 -8.0 1204 33 7.333333333333332 1204 34 7.666666666666668 1204 35 6.333333333333332 1204 36 7.0 1204 37 4.0 1204 38 7.0 1204 39 -14.666666666666668 1204 40 -11.333333333333332 1204 41 -13.666666666666668 1204 42 -2.333333333333332 1204 43 -5.333333333333332 1204 44 -11.666666666666668 1204 45 -9.666666666666668 1204 46 -5.333333333333332 1204 47 -11.333333333333332 1204 48 -7.0 1204 49 -12.0 1204 50 -12.666666666666668 1213 1 8.666666666666668 1213 2 10.0 1213 3 10.333333333333332 1213 4 11.666666666666668 1213 5 13.666666666666668 1213 6 18.666666666666668 1213 7 11.666666666666668 1213 8 11.666666666666668 1213 9 8.666666666666668 1213 10 12.0 1213 11 12.0 1213 12 7.666666666666668 1213 13 12.333333333333332 1213 14 12.333333333333332 1213 15 11.333333333333332 1213 16 12.666666666666668 1213 17 12.0 1213 18 10.666666666666668 1213 19 8.666666666666668 1213 20 13.0 1213 21 12.666666666666668 1213 22 8.0 1213 23 10.666666666666668 1213 24 11.333333333333332 1213 25 10.666666666666668 1213 26 8.333333333333336 1213 27 14.0 1213 28 11.333333333333332 1213 29 15.0 1213 30 12.0 1213 31 12.333333333333332 1213 32 10.0 1213 33 10.333333333333332 1213 34 9.666666666666668 1213 35 10.333333333333332 1213 36 10.0 1213 37 13.0 1213 38 10.0 1213 39 14.333333333333332 1213 40 15.666666666666668 1213 41 13.333333333333332 1213 42 10.666666666666668 1213 43 7.666666666666668 1213 44 15.333333333333332 1213 45 12.333333333333332 1213 46 7.666666666666668 1213 47 10.666666666666668 1213 48 17.0 1213 49 16.0 1213 50 16.333333333333332 2114 1 -13.333333333333332 2114 2 -12.0 2114 3 -16.666666666666668 2114 4 -18.333333333333332 2114 5 -16.333333333333332 2114 6 -11.333333333333332 2114 7 -18.333333333333332 2114 8 -18.333333333333332 2114 9 -14.333333333333332 2114 10 -20.0 2114 11 -20.0 2114 12 -6.333333333333332 2114 13 -19.666666666666668 2114 14 -21.666666666666668 2114 15 -14.666666666666668 2114 16 -21.333333333333332 2114 17 -22.0 2114 18 -21.333333333333332 2114 19 -18.333333333333332 2114 20 -21.0 2114 21 -22.333333333333332 2114 22 -13.0 2114 23 -19.333333333333332 2114 24 -11.666666666666668 2114 25 -11.333333333333332 2114 26 -6.666666666666664 2114 27 -19.0 2114 28 -19.666666666666668 2114 29 -16.0 2114 30 -2.0 2114 31 -1.6666666666666679 2114 32 -2.0 2114 33 -17.666666666666668 2114 34 -17.333333333333332 2114 35 -16.666666666666668 2114 36 -17.0 2114 37 -17.0 2114 38 -17.0 2114 39 0.33333333333333215 2114 40 -4.333333333333332 2114 41 0.33333333333333215 2114 42 -8.333333333333332 2114 43 -2.333333333333332 2114 44 -3.666666666666668 2114 45 -2.666666666666668 2114 46 -2.333333333333332 2114 47 0.6666666666666679 2114 48 -10.0 2114 49 -4.0 2114 50 -3.666666666666668 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 12 1.0 13 1.0 14 0.0 15 0.0 16 1.0 17 0.0 18 0.0 19 3.0 20 1.0 21 0.0 22 1.0 23 2.0 24 3.0 25 1.0 26 2.0 27 1.0 28 0.0 29 1.0 30 1.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 1.0 35 1.0 36 2.0 37 5.0 38 2.0 39 6.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 38.88888888888889 13.88888888888889 13.88888888888889 33.33333333333333 2 19.444444444444446 16.666666666666664 36.11111111111111 27.77777777777778 3 44.44444444444444 11.11111111111111 30.555555555555557 13.88888888888889 4 13.88888888888889 19.444444444444446 27.77777777777778 38.88888888888889 5 27.77777777777778 19.444444444444446 41.66666666666667 11.11111111111111 6 50.0 22.22222222222222 16.666666666666664 11.11111111111111 7 36.11111111111111 19.444444444444446 16.666666666666664 27.77777777777778 8 27.77777777777778 36.11111111111111 8.333333333333332 27.77777777777778 9 30.555555555555557 22.22222222222222 5.555555555555555 41.66666666666667 10 16.666666666666664 11.11111111111111 33.33333333333333 38.88888888888889 11 38.88888888888889 16.666666666666664 13.88888888888889 30.555555555555557 12 25.0 13.88888888888889 16.666666666666664 44.44444444444444 13 25.0 13.88888888888889 30.555555555555557 30.555555555555557 14 27.77777777777778 19.444444444444446 5.555555555555555 47.22222222222222 15 25.0 27.77777777777778 13.88888888888889 33.33333333333333 16 41.66666666666667 16.666666666666664 19.444444444444446 22.22222222222222 17 38.88888888888889 25.0 13.88888888888889 22.22222222222222 18 36.11111111111111 27.77777777777778 11.11111111111111 25.0 19 41.66666666666667 2.7777777777777777 19.444444444444446 36.11111111111111 20 36.11111111111111 16.666666666666664 27.77777777777778 19.444444444444446 21 38.88888888888889 8.333333333333332 13.88888888888889 38.88888888888889 22 27.77777777777778 19.444444444444446 22.22222222222222 30.555555555555557 23 33.33333333333333 13.88888888888889 27.77777777777778 25.0 24 44.44444444444444 19.444444444444446 5.555555555555555 30.555555555555557 25 36.11111111111111 13.88888888888889 16.666666666666664 33.33333333333333 26 41.66666666666667 8.333333333333332 16.666666666666664 33.33333333333333 27 25.0 25.0 19.444444444444446 30.555555555555557 28 36.11111111111111 30.555555555555557 13.88888888888889 19.444444444444446 29 33.33333333333333 13.88888888888889 33.33333333333333 19.444444444444446 30 25.0 25.0 13.88888888888889 36.11111111111111 31 33.33333333333333 11.11111111111111 19.444444444444446 36.11111111111111 32 38.88888888888889 16.666666666666664 8.333333333333332 36.11111111111111 33 30.555555555555557 25.0 11.11111111111111 33.33333333333333 34 36.11111111111111 13.88888888888889 13.88888888888889 36.11111111111111 35 36.11111111111111 22.22222222222222 19.444444444444446 22.22222222222222 36 25.0 22.22222222222222 19.444444444444446 33.33333333333333 37 41.66666666666667 25.0 11.11111111111111 22.22222222222222 38 30.555555555555557 25.0 13.88888888888889 30.555555555555557 39 38.88888888888889 11.11111111111111 19.444444444444446 30.555555555555557 40 44.44444444444444 22.22222222222222 11.11111111111111 22.22222222222222 41 33.33333333333333 11.11111111111111 27.77777777777778 27.77777777777778 42 27.77777777777778 27.77777777777778 11.11111111111111 33.33333333333333 43 22.22222222222222 13.88888888888889 47.22222222222222 16.666666666666664 44 25.0 27.77777777777778 13.88888888888889 33.33333333333333 45 33.33333333333333 5.555555555555555 27.77777777777778 33.33333333333333 46 27.77777777777778 13.88888888888889 22.22222222222222 36.11111111111111 47 27.77777777777778 22.22222222222222 33.33333333333333 16.666666666666664 48 33.33333333333333 2.7777777777777777 41.66666666666667 22.22222222222222 49 27.77777777777778 19.444444444444446 19.444444444444446 33.33333333333333 50 30.555555555555557 5.555555555555555 44.44444444444444 19.444444444444446 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.5 36 1.0 37 0.5 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 1.0 42 2.0 43 1.5 44 1.0 45 0.5 46 0.0 47 1.0 48 2.0 49 2.5 50 3.0 51 3.0 52 3.0 53 2.0 54 1.0 55 1.0 56 1.0 57 1.0 58 1.0 59 1.5 60 2.0 61 2.0 62 2.0 63 2.5 64 3.0 65 2.5 66 2.0 67 2.5 68 3.0 69 2.0 70 1.0 71 1.0 72 1.0 73 0.5 74 0.0 75 0.0 76 0.0 77 0.0 78 0.0 79 2.0 80 4.0 81 2.0 82 0.0 83 1.5 84 3.0 85 1.5 86 0.0 87 0.0 88 0.0 89 0.0 90 0.0 91 0.0 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 50 36.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source GTCCTGCCGCTCACCGCGTGGCGGGGGGGGGGGCCCGCGCTGTTCATCGC 1 2.7777777777777777 No Hit ACTTGGTCATCTCTGCAGGAGATGCTTAGGCCAAAAGTACCATCCGTGGG 1 2.7777777777777777 No Hit TCACGTGGGTTTTCAAAAGAACACCCCCGCTGGGGGGGCGGGGGGGGGCT 1 2.7777777777777777 No Hit CGGCTGCGCCGACGCGGACTGGGCCGACGCGGACCTGACCGGCAGCGTCG 1 2.7777777777777777 No Hit GCGCGGGCGCGGTGTGGACCGACGGGGAAGGGGGCCTCGGCAGCCGCCCC 1 2.7777777777777777 No Hit ATGCTTGACCACCACTTAGGTAGCTTATCTCCAGGAAAATGATAGCTGTT 1 2.7777777777777777 No Hit ACGTTGGCGACGCCCCACTAGCAAGCCGCCTCCTGAAACACCTCCCTTGT 1 2.7777777777777777 No Hit TCTATGTGCTGATCCGGCGCCACCTGCATCGCACTTGAGGGGGCCTTGTG 1 2.7777777777777777 No Hit GTGAAGGACGCGCACCCGGGCATGCAGATCGCCGTCGGCCTGTCTCTTAT 1 2.7777777777777777 No Hit TTTTCGCTTCCCACAGGTCTCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCG 1 2.7777777777777777 No Hit CCGCCACCGCCGGCGAGACGCCCACCGACGAGAACGAGGGCCTGCCGGCG 1 2.7777777777777777 No Hit TAGCGGAATCGGGGGTATGCTGTTCGAATTCATAAGAACAGGGAGGTTAG 1 2.7777777777777777 No Hit AGACCGGGGTCTCCTCGAGCTTGACGCGGACGTAGAGCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit GCTTAAAACTCAAAGGACCTGGCGGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCT 1 2.7777777777777777 No Hit CAGCACGTCCTCGGCGGGGGCGGCCTCCTCCCCGTCTCTTATAAACATCT 1 2.7777777777777777 No Hit CTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTAT 1 2.7777777777777777 No Hit CTTATACACACCTGACGCGGCCGACGAAACTGGCGGTGTAGAGATCGGGG 1 2.7777777777777777 No Hit GATCGCGGGCGCCACGAGCGCCTCGGGGCGGGCCGCCACGCGCACGCTCC 1 2.7777777777777777 No Hit CACCACGAGGACGATGTCGACCGGCACCCCGGTCTCGGTCTGCATGGTCT 1 2.7777777777777777 No Hit GGGTTTGGATGTGAGTGGCGGTTAGTGCGAGGGCTAAGGGGCGCTTTGGA 1 2.7777777777777777 No Hit CTGCCAGGCTCCACTGGGCCTGGAGGTGCAATCCTACGGCCTTGGAACTG 1 2.7777777777777777 No Hit GTCGTGTAGCGGTGAAAGTGGTTTGGTTTAGACGTCCGGGAATTGCATCT 1 2.7777777777777777 No Hit CTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAATCTGGCGGTGTAGATTTCGGTT 1 2.7777777777777777 No Hit AGTATGCAGTGTGGAGAAAACAGGTGTGTGGCAAGTGTAGGAAGGGATGG 1 2.7777777777777777 No Hit GCGTTCGAGCGCCAGGACGACTGGGGCGGCCAGTGGAACCTCTGTCTCTT 1 2.7777777777777777 No Hit GTATTAGCAAACTCATCACTAGACATCGTACTACACGACACGTACTACGT 1 2.7777777777777777 No Hit CGCTGACACCGCGCGGGGCCCTCCTCCTGACCGGAGCGGTCAACACCTGT 1 2.7777777777777777 No Hit GATGTGCGCGTACCGGTGGTTGTCGAAGAGCCGGAAGCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit CTTAATACACATCTGACGCTGCCGACGAATGACCATGTGGCGATCTCGGT 1 2.7777777777777777 No Hit GGGAGATCATAGACAACTCGGTGGACGAGGCGCGGGCCGGCTTCGGGCAG 1 2.7777777777777777 No Hit TTTTTGACAGGGTGCTGATTGGTGCGTTTACAATCCCTGAGCTAGATACA 1 2.7777777777777777 No Hit GGGGAGATCTCCGCCACGGGCGCGGTGGGCTCCGCGCCGGTCTCGGGGCT 1 2.7777777777777777 No Hit GTCGGGCGCGACGCCGCCGCGCTGGGACGACGCCGTGCGGGACGCCGTGC 1 2.7777777777777777 No Hit CCGCGGACATCGCCCTGATGGGCGACCGGCTCGGGCGCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit GCGGTGTACCGCTCACCGGTGACGGCCATGCGGGCCCGGATCAGGGTCTT 1 2.7777777777777777 No Hit CAGCGTAGATGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGATCCGTG 1 2.7777777777777777 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content fail #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA 3' Adapter Illumina Small RNA 5' Adapter Nextera Transposase Sequence SOLID Small RNA Adapter 1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 13 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 14 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 15 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 16 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 17 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 18 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 19 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 20 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 21 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 22 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 23 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 24 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 25 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 26 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 27 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 28 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 29 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 30 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 31 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 32 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 33 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 34 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 35 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 36 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 37 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 38 0.0 0.0 0.0 16.666666666666668 0.0 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE