##FastQC 0.11.5 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename SRR1780551_1.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 36 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 50 %GC 62 >>END_MODULE >>Per base sequence quality pass #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 33.111111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 2 33.27777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 3 33.5 NaN NaN NaN NaN NaN 4 36.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 5 36.833333333333336 NaN NaN NaN NaN NaN 6 36.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 7 36.75 NaN NaN NaN NaN NaN 8 36.666666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 9 38.361111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 10 37.97222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 11 38.361111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 12 38.47222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 13 38.5 NaN NaN NaN NaN NaN 14 39.888888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 15 40.22222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 16 40.22222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 17 40.361111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 18 40.22222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 19 40.25 NaN NaN NaN NaN NaN 20 40.25 NaN NaN NaN NaN NaN 21 39.97222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 22 40.25 NaN NaN NaN NaN NaN 23 39.666666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 24 39.638888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 25 39.75 NaN NaN NaN NaN NaN 26 39.416666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 27 39.47222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 28 39.25 NaN NaN NaN NaN NaN 29 39.361111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 30 38.80555555555556 NaN NaN NaN NaN NaN 31 38.80555555555556 NaN NaN NaN NaN NaN 32 38.416666666666664 NaN NaN NaN NaN NaN 33 38.52777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 34 38.27777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 35 38.138888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 36 37.333333333333336 NaN NaN NaN NaN NaN 37 36.861111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 38 36.75 NaN NaN NaN NaN NaN 39 36.44444444444444 NaN NaN NaN NaN NaN 40 37.111111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 41 37.111111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 42 36.77777777777778 NaN NaN NaN NaN NaN 43 36.638888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 44 36.75 NaN NaN NaN NaN NaN 45 36.22222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 46 36.72222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN 47 36.611111111111114 NaN NaN NaN NaN NaN 48 36.638888888888886 NaN NaN NaN NaN NaN 49 36.55555555555556 NaN NaN NaN NaN NaN 50 35.72222222222222 NaN NaN NaN NaN NaN >>END_MODULE >>Per tile sequence quality warn #Tile Base Mean 1204 1 0.0 1204 2 -0.3333333333333357 1204 3 0.0 1204 4 0.0 1204 5 0.0 1204 6 0.0 1204 7 0.0 1204 8 0.0 1204 9 0.0 1204 10 0.0 1204 11 0.0 1204 12 1.3333333333333357 1204 13 0.6666666666666643 1204 14 4.0 1204 15 2.0 1204 16 2.3333333333333357 1204 17 1.3333333333333357 1204 18 1.6666666666666643 1204 19 2.0 1204 20 2.3333333333333357 1204 21 2.3333333333333357 1204 22 2.3333333333333357 1204 23 3.0 1204 24 2.3333333333333357 1204 25 3.0 1204 26 2.6666666666666643 1204 27 3.0 1204 28 3.0 1204 29 3.3333333333333357 1204 30 4.666666666666664 1204 31 4.333333333333336 1204 32 4.333333333333336 1204 33 4.666666666666664 1204 34 4.0 1204 35 4.666666666666664 1204 36 5.333333333333336 1204 37 4.0 1204 38 -6.0 1204 39 2.0 1204 40 3.0 1204 41 3.3333333333333357 1204 42 4.0 1204 43 4.0 1204 44 4.0 1204 45 8.0 1204 46 4.0 1204 47 4.0 1204 48 4.0 1204 49 4.666666666666664 1204 50 4.0 1213 1 0.0 1213 2 0.6666666666666643 1213 3 0.0 1213 4 0.0 1213 5 0.0 1213 6 0.0 1213 7 0.0 1213 8 0.0 1213 9 0.0 1213 10 0.0 1213 11 0.0 1213 12 -2.6666666666666643 1213 13 -1.3333333333333357 1213 14 -7.0 1213 15 -2.0 1213 16 0.3333333333333357 1213 17 -0.6666666666666643 1213 18 0.6666666666666643 1213 19 0.0 1213 20 1.3333333333333357 1213 21 1.3333333333333357 1213 22 1.3333333333333357 1213 23 0.0 1213 24 1.3333333333333357 1213 25 0.0 1213 26 0.6666666666666643 1213 27 0.0 1213 28 0.0 1213 29 1.3333333333333357 1213 30 -3.3333333333333357 1213 31 -1.6666666666666643 1213 32 -2.6666666666666643 1213 33 -1.3333333333333357 1213 34 -2.0 1213 35 -3.3333333333333357 1213 36 -0.6666666666666643 1213 37 -1.0 1213 38 3.0 1213 39 0.0 1213 40 -2.0 1213 41 -1.6666666666666643 1213 42 -1.0 1213 43 -2.0 1213 44 -2.0 1213 45 0.0 1213 46 -2.0 1213 47 -2.0 1213 48 -2.0 1213 49 -1.3333333333333357 1213 50 -2.0 2114 1 0.0 2114 2 -0.3333333333333357 2114 3 0.0 2114 4 0.0 2114 5 0.0 2114 6 0.0 2114 7 0.0 2114 8 0.0 2114 9 0.0 2114 10 0.0 2114 11 0.0 2114 12 1.3333333333333357 2114 13 0.6666666666666643 2114 14 3.0 2114 15 0.0 2114 16 -2.6666666666666643 2114 17 -0.6666666666666643 2114 18 -2.3333333333333357 2114 19 -2.0 2114 20 -3.6666666666666643 2114 21 -3.6666666666666643 2114 22 -3.6666666666666643 2114 23 -3.0 2114 24 -3.6666666666666643 2114 25 -3.0 2114 26 -3.3333333333333357 2114 27 -3.0 2114 28 -3.0 2114 29 -4.666666666666664 2114 30 -1.3333333333333357 2114 31 -2.6666666666666643 2114 32 -1.6666666666666643 2114 33 -3.3333333333333357 2114 34 -2.0 2114 35 -1.3333333333333357 2114 36 -4.666666666666664 2114 37 -3.0 2114 38 3.0 2114 39 -2.0 2114 40 -1.0 2114 41 -1.6666666666666643 2114 42 -3.0 2114 43 -2.0 2114 44 -2.0 2114 45 -8.0 2114 46 -2.0 2114 47 -2.0 2114 48 -2.0 2114 49 -3.3333333333333357 2114 50 -2.0 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 30 1.0 31 0.0 32 0.0 33 2.0 34 1.0 35 2.0 36 5.0 37 3.0 38 6.0 39 16.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 44.44444444444444 16.666666666666664 5.555555555555555 33.33333333333333 2 16.666666666666664 22.22222222222222 36.11111111111111 25.0 3 33.33333333333333 16.666666666666664 11.11111111111111 38.88888888888889 4 22.22222222222222 8.333333333333332 27.77777777777778 41.66666666666667 5 13.88888888888889 30.555555555555557 33.33333333333333 22.22222222222222 6 30.555555555555557 30.555555555555557 8.333333333333332 30.555555555555557 7 47.22222222222222 13.88888888888889 19.444444444444446 19.444444444444446 8 33.33333333333333 22.22222222222222 16.666666666666664 27.77777777777778 9 19.444444444444446 8.333333333333332 16.666666666666664 55.55555555555556 10 25.0 8.333333333333332 30.555555555555557 36.11111111111111 11 47.22222222222222 22.22222222222222 8.333333333333332 22.22222222222222 12 36.11111111111111 11.11111111111111 22.22222222222222 30.555555555555557 13 30.555555555555557 11.11111111111111 16.666666666666664 41.66666666666667 14 19.444444444444446 25.0 19.444444444444446 36.11111111111111 15 55.55555555555556 8.333333333333332 11.11111111111111 25.0 16 16.666666666666664 25.0 8.333333333333332 50.0 17 25.0 16.666666666666664 27.77777777777778 30.555555555555557 18 22.22222222222222 19.444444444444446 22.22222222222222 36.11111111111111 19 30.555555555555557 19.444444444444446 25.0 25.0 20 33.33333333333333 11.11111111111111 16.666666666666664 38.88888888888889 21 30.555555555555557 25.0 5.555555555555555 38.88888888888889 22 30.555555555555557 25.0 16.666666666666664 27.77777777777778 23 30.555555555555557 19.444444444444446 11.11111111111111 38.88888888888889 24 50.0 11.11111111111111 11.11111111111111 27.77777777777778 25 30.555555555555557 13.88888888888889 25.0 30.555555555555557 26 27.77777777777778 16.666666666666664 16.666666666666664 38.88888888888889 27 33.33333333333333 22.22222222222222 13.88888888888889 30.555555555555557 28 33.33333333333333 19.444444444444446 13.88888888888889 33.33333333333333 29 27.77777777777778 16.666666666666664 16.666666666666664 38.88888888888889 30 33.33333333333333 13.88888888888889 13.88888888888889 38.88888888888889 31 19.444444444444446 22.22222222222222 22.22222222222222 36.11111111111111 32 22.22222222222222 11.11111111111111 16.666666666666664 50.0 33 22.22222222222222 36.11111111111111 13.88888888888889 27.77777777777778 34 33.33333333333333 16.666666666666664 11.11111111111111 38.88888888888889 35 33.33333333333333 16.666666666666664 36.11111111111111 13.88888888888889 36 38.88888888888889 16.666666666666664 13.88888888888889 30.555555555555557 37 36.11111111111111 13.88888888888889 19.444444444444446 30.555555555555557 38 30.555555555555557 16.666666666666664 8.333333333333332 44.44444444444444 39 30.555555555555557 19.444444444444446 33.33333333333333 16.666666666666664 40 25.0 5.555555555555555 27.77777777777778 41.66666666666667 41 22.22222222222222 19.444444444444446 36.11111111111111 22.22222222222222 42 11.11111111111111 13.88888888888889 36.11111111111111 38.88888888888889 43 30.555555555555557 22.22222222222222 27.77777777777778 19.444444444444446 44 27.77777777777778 13.88888888888889 16.666666666666664 41.66666666666667 45 25.0 22.22222222222222 19.444444444444446 33.33333333333333 46 22.22222222222222 16.666666666666664 13.88888888888889 47.22222222222222 47 11.11111111111111 22.22222222222222 19.444444444444446 47.22222222222222 48 25.0 11.11111111111111 22.22222222222222 41.66666666666667 49 25.0 33.33333333333333 16.666666666666664 25.0 50 25.0 13.88888888888889 36.11111111111111 25.0 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.5 42 1.0 43 0.5 44 0.0 45 0.5 46 1.0 47 2.0 48 3.0 49 2.5 50 2.0 51 3.0 52 4.0 53 3.5 54 3.0 55 2.0 56 1.0 57 1.0 58 1.0 59 0.5 60 0.0 61 1.0 62 2.0 63 2.0 64 2.0 65 3.0 66 4.0 67 2.5 68 1.0 69 1.0 70 1.0 71 1.5 72 2.0 73 1.5 74 1.0 75 1.5 76 2.0 77 1.0 78 0.0 79 1.0 80 2.0 81 1.0 82 0.0 83 1.0 84 2.0 85 1.5 86 1.0 87 0.5 88 0.0 89 0.0 90 0.0 91 0.0 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 50 36.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source CCCTACTTCTAACCTCCCTGTTCTTATGAATTCGAACAGCATACCCCCGA 1 2.7777777777777777 No Hit CGCTCGAGCCGGTCGCCCATCAGGGCGATGTCCGCGGCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit ATACACATCTCCGAGCCCACGAGACCCAAATAAATCTCGTATGCCGTCTT 1 2.7777777777777777 No Hit GAGTTGGAGGCCTCGATCACCCGGTAGATGTCGATGCCGTTCGCGCCGGC 1 2.7777777777777777 No Hit CTCTACGTCCGCGTCAAGCTCGAGGAGACCCCGGTCTCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit GTTGCCTTCCAAGGCCATTCATCCTGTTCTCTTTTTGGGCTCCTGTAGCA 1 2.7777777777777777 No Hit TTCCAAGGCCGTAGGATTGCACCTCCAGGCCCAGTGGAGCCTGGCAGCTG 1 2.7777777777777777 No Hit CATCTACGCTGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACCCAAA 1 2.7777777777777777 No Hit GGAGGAGGCCGCCACCGCCGAGGACGTGCTGCTGTCTCTTATACACATCT 1 2.7777777777777777 No Hit CTCCTATGATGGCAAATACAGCTCCTATTGATAGGACATAGTGGAAGTGA 1 2.7777777777777777 No Hit GTGCGGGCGGGCAGGTCGCGGACCGCCAGCTCGGAGACGACGCCGGCCAC 1 2.7777777777777777 No Hit ACCATGCAGACCGAGACCGGGGTGCCGGTCGACATCGTCCTCGTGGTGCT 1 2.7777777777777777 No Hit GTGTTGACCGCTCCGGTCAGGAGGAGGGCCCCGCGCGGTGTCAGCGCTGT 1 2.7777777777777777 No Hit GCCGACGGCGATCTGCATGCCCGGGTGCGCGTCCTTCACCTGTCTCTTAT 1 2.7777777777777777 No Hit AAGGTGCAGTCGCCCCGGGAGACCAGGGCGACGCTGCCGGTCAGGTCCGC 1 2.7777777777777777 No Hit GAGACCTGTGGGAAGCGAAAACTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCAC 1 2.7777777777777777 No Hit CCCCGAGACCGGCGCGGAGCCCACCGCGCCCGTGGCGGAGATCTCCCCCT 1 2.7777777777777777 No Hit GTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACCCAACACGATCTCGTATGCCGTC 1 2.7777777777777777 Illumina PCR Primer Index 1 (95% over 22bp) AGGTTCCACTGGCCGCCCCAGTCGTCCTGGCGCTCGAACGCCTGTCTCTT 1 2.7777777777777777 No Hit GAGCTACCTTAGACCATTGCCAAGGCCAAATTGCGGCAGCTTTCACCCAG 1 2.7777777777777777 No Hit GGGTGATCTCGATCGACTGCCCGAAGCCGGCCAGAGCCTCGTCCACCGAG 1 2.7777777777777777 No Hit CACCAGGGCGATGAACAGCGCGGGCACCCCCCACCGCCACGCGGTGAGCG 1 2.7777777777777777 No Hit TCTTATACAGATCTCCGAGCCACGAGACGGCGTCGAATCTCGTATGCCGT 1 2.7777777777777777 No Hit GTATCTAGCTGCTCTGGTGGGGCCTTGGAGAACCTGTGTGTCAAAACTCT 1 2.7777777777777777 No Hit CAAGACGTCTTGCACTCATGAGCTGTCCCCACATTAGGCTTAAAAACAGA 1 2.7777777777777777 No Hit CTACAAGGCCACCTCAAGTGCGATGCAGGTGGCACCGGATCAGCACAGCG 1 2.7777777777777777 No Hit CCAGAACACTACGAGCCCACGAGACGATCCAAAATCTCGTATGCCGTCTT 1 2.7777777777777777 Illumina PCR Primer Index 6 (95% over 22bp) ATCCTCGCCGGCGCGGCATGGCCGGGAGCGCGCCGGCGAGGATGCACCAT 1 2.7777777777777777 No Hit GTCGAGGAGCGTGCGCGTGGCGGCCCGCCCCGAGGCGCTCGTGGCGCCCG 1 2.7777777777777777 No Hit GGGCCGCCGTGGGCGCGGATCGCGGCGCGGACCCTGTCTCTTATACACAT 1 2.7777777777777777 No Hit GCGAGCGCCCGGGCGGCCTCGGGGTCGAGCCGACCGGGGCGGCGGACGAG 1 2.7777777777777777 No Hit CTTCCGGCTCTTCGACAACCACCGGTACGCGCACATCCTGTCTCTTATAC 1 2.7777777777777777 No Hit GCCCTCGCCGCGGTGCTCGCCCTCGACGCGGCCGGTGGTCCCCCGCTGGG 1 2.7777777777777777 No Hit GAGGTGGTGCTGCGGGTGTCCTCGTGCCAGTGGCGGGGGTCCTCCCTCCT 1 2.7777777777777777 No Hit CCGCCAGGTCCTTTGAGTTTTAAGCCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGC 1 2.7777777777777777 No Hit AGCCTATGAAGGCTGTTGCTATAGTTGCAAGCAGGAGGATAATGCCGATG 1 2.7777777777777777 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content fail #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA 3' Adapter Illumina Small RNA 5' Adapter Nextera Transposase Sequence SOLID Small RNA Adapter 1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 13 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 14 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 15 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 16 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 17 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 18 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 19 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 20 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 21 0.0 0.0 0.0 2.7777777777777777 0.0 22 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 23 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 24 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 25 0.0 0.0 0.0 5.555555555555555 0.0 26 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 27 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 28 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 29 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 30 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 31 0.0 0.0 0.0 8.333333333333334 0.0 32 0.0 0.0 0.0 11.11111111111111 0.0 33 0.0 0.0 0.0 11.11111111111111 0.0 34 0.0 0.0 0.0 13.88888888888889 0.0 35 0.0 0.0 0.0 13.88888888888889 0.0 36 0.0 0.0 0.0 13.88888888888889 0.0 37 0.0 0.0 0.0 13.88888888888889 0.0 38 0.0 0.0 0.0 22.22222222222222 0.0 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE