SRR1526657_1.fastq FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	SRR1526657_1.fastq
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	1912
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	64
%GC	42

Per base sequence quality

Per base quality graph

Per tile sequence quality

Per base quality graph

Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

Per base sequence content

Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

Per base N content

N content graph

Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

Overrepresented sequences

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
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CCTTTCGGGGTGTGGCCATCAAGATCCCCAAAAAAAAAAAAAGATCGGAAGAGCTCGTATGCCG	2	0.10460251046025104	Illumina Single End Adapter 2 (100% over 23bp)
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CCTTTCGGGGCGACCCCAGGTCAGGTGGGGCTCTCACCCTCCCCGGCGCCCCTTTCCAGGGGAC	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGACAAACAATTGTTGAAGAAGAAGGATACATTGCAGTAGTTGAAGAAGCAGCAGCT	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGCGCCTCGCCGCTGGCGGAGGGACGGCGACCTGATGCAGCTTGCTGTCATCGCCCT	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGGCGACCCCAGGTCAGGCGGGGTTACCCGCTGAATTTAAGCATATCAATAAGCGGA	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGGTGTGGCCATCAAGATCCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGGGAGGGCTGTTCAGGATGGGGAACACATGTACACCCATGGCTGATTCATGTCAAT	2	0.10460251046025104	No Hit
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CCTTTCGGGGTCACCCCTAACAAGGCAATCTGGAAGCAGAAATGCAAACTCCAGCCCCACCACA	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGGGTTTTTCTTTGCTTTAAAATTATGTACCTTTTCCTTTTTTCCATTTTTTAAAGA	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGATGGGCTTTTGCCTGAATTATGGTTGTTTTAGCTGTAGATGTTTCAAACCTTGAT	2	0.10460251046025104	No Hit
CCTTTCGGGGTGTGGCCATCAAGATCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGG	2	0.10460251046025104	No Hit
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CCTTTCGGGGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTC	2	0.10460251046025104	No Hit
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CCTTTCGGGAGTGGTGTTCCAAAAGTCCTGCCCTCTAGCCAACCACCTATATCCTGCTCAGAGG	2	0.10460251046025104	No Hit
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CCTTTCGGGGGGGTTGGCGGCGCGTTGATTATCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGCTTGTGGG	2	0.10460251046025104	No Hit

Adapter Content

Adapter graph

Kmer Content

Kmer graph

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GTTGATG	15	0.0040006205	58.000004	36
AAACTGC	15	0.0040006205	58.000004	19
TCCTTCG	15	0.0040006205	58.000004	16
GGTTGAT	15	0.0040006205	58.000004	35
GAAACTG	15	0.0040006205	58.000004	18
AAACATC	15	0.0040006205	58.000004	48
ACTGACG	15	0.0040006205	58.000004	57
AATTCCT	15	0.0040006205	58.000004	13
AACTGAC	15	0.0040006205	58.000004	56
GGCAACA	15	0.0040006205	58.000004	22
GATGCTG	15	0.0040006205	58.000004	39
TCGGCAA	15	0.0040006205	58.000004	20
TCGAACT	15	0.0040006205	58.000004	53
GAAAAAC	15	0.0040006205	58.000004	45
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CAACATT	15	0.0040006205	58.000004	24
CTGACGG	15	0.0040006205	58.000004	58
ACATCGA	15	0.0040006205	58.000004	50
GCAACAT	15	0.0040006205	58.000004	23

Summary

Basic Statistics

Per base sequence quality

Per tile sequence quality

Per sequence quality scores

Per base sequence content

Per sequence GC content

Per base N content

Sequence Length Distribution

Sequence Duplication Levels

Overrepresented sequences

Adapter Content

Kmer Content