FastQCFastQC Report
Fri 17 Jun 2016
SRR1525908_1.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameSRR1525908_1.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences464
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length40
%GC42

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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