FastQCFastQC Report
Fri 10 Feb 2017
ERR1632685.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameERR1632685.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences150
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length43
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAA21.3333333333333335No Hit
TTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCACTCGTCAGCAACTGT10.6666666666666667No Hit
ACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACCTGTC10.6666666666666667No Hit
CCTCCGAGCAGTACATGCTAAGACTTCACCAGTCAAAGCGAAC10.6666666666666667No Hit
TGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACTCAGTGCCCTGTCTCTTA10.6666666666666667No Hit
ACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCT10.6666666666666667No Hit
ATCATATTCATCGGCGTAAATCTAACCTTCTTCCCACAACACT10.6666666666666667No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT10.6666666666666667No Hit
GTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAGCATGTGCATTTTTGTG10.6666666666666667No Hit
AAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGG10.6666666666666667No Hit
GTAATACCCATCATAATCGGAGGCTTTGGCAACTGACTAGTTC10.6666666666666667No Hit
ATGTCGTTATCACCGAGGCAATCGCACTTCATGGTCACTAAAG10.6666666666666667No Hit
GTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGAT10.6666666666666667No Hit
CCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTG10.6666666666666667No Hit
GCGTTGAGCCTCGGACCATTGGTCGGCGAGCCCTTGCCGCCCG10.6666666666666667No Hit
GTGATGACGAGGCACTACGGTGCTGAAGCAACAAATGCCCTGT10.6666666666666667No Hit
CTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTT10.6666666666666667No Hit
GTGGTGGCAGCAGCCACAGGGGCAGCAGCCACCAAGGCAGCTG10.6666666666666667No Hit
GCCTTCCTAGTAGCTGTGATTACAGGTGCCTGTCACTATGCCC10.6666666666666667No Hit
GGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTC10.6666666666666667No Hit
GGCAAAACTTTTCAGGCGAATTTCCGCCCCTGGCGCTCTAGGC10.6666666666666667No Hit
CCAACATTCTCCACCGACTGCGTCAGGATGAGCTCCAGGTCTG10.6666666666666667No Hit
AAGCTTGTACATTTTGCCCTTAGCTTTTTGTTTCCTAGCTTGT10.6666666666666667No Hit
GGGTACGGCCCGGCGCGAGATTTACACCCTCTCCCCCGGATTT10.6666666666666667No Hit
GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCC10.6666666666666667No Hit
CGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTA10.6666666666666667No Hit
ACCTTTCACAGGAATGTTTTATTGTCTCTGCCTGGACTTCTAA10.6666666666666667No Hit
ATATCCCACAAATTCTGATATTTGGGGGTTTTTTTTTTTTTTT10.6666666666666667No Hit
GGGATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT10.6666666666666667No Hit
GATATGTCAGATCGGAATAATTTACATTTACAAATTATATCAT10.6666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGTGAGACACGGTCCAGACTCTGTCT10.6666666666666667No Hit
ATCCAGATCATTCTCAGCTTCCCAGGCAGACCCACTCAGTGAT10.6666666666666667No Hit
GATGAACCGACTCTTCGGGAAAGCGAAACCCAAGGCTCCGCCG10.6666666666666667No Hit
GGGTGGAAGGTGATTTTATCGGAATGGGAGGTGATTCCTAGGG10.6666666666666667No Hit
GGCGACATCTGGTGCTGCTCAACATCCAGGACTATCTGTCTCT10.6666666666666667No Hit
GCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCT10.6666666666666667No Hit
CAATGGTGGAGTTGGCAGGTGTGCGCAGGCCAAGCAATGGGGC10.6666666666666667No Hit
GCCGCACACAGACTTCACCCTGTACAAGTGCATGATCGACCAG10.6666666666666667No Hit
ATTTAAAGCCTAGTTAACGCATTTACTAAACGCAGACGAAAAT10.6666666666666667No Hit
GCCTTGTACCAGCATTACAAATAATCCAGCCACAAAGTAAATG10.6666666666666667No Hit
GGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTT10.6666666666666667No Hit
CAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT10.6666666666666667No Hit
GTTTCATACCCATCGTCCTAGAATTAATTCCCCTAAAAATCTT10.6666666666666667No Hit
GGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACCTGTCTCTTAT10.6666666666666667No Hit
GACCTTAGTGATGCCCAGTTGACCCAGGACGCTCTTCAGATCA10.6666666666666667No Hit
ACGGGATCCTTGGTCCCGAGGGCCACCAAATTTATTGAAGCCA10.6666666666666667No Hit
CCGCCACCGTGGCGATGCCCATTTCCTTGCAGGCGCGGTGAAC10.6666666666666667No Hit
GATCTGAACTTTTCATCTGCAGAGGCAAGAAAAATATTTGACA10.6666666666666667No Hit
CCCATATTCAGACAGGATCCCGTACTCTGCGTTGATACTGTCT10.6666666666666667No Hit
CCGTCATCTTTAGTGACCATGAAGTCGATTGCCTCGGTGATAA10.6666666666666667No Hit
CTGCTTGTGCCTCGGATGGGTTTTACAGTAGACGTACCACCGA10.6666666666666667No Hit
CTGCACGGGCATTGAACTGCTCGTGACGGGGGGTGCAGAGCTG10.6666666666666667No Hit
GCGTAGAATTGCAGGTCTCTGTACGGGCCAGTTTCTCTGCCTT10.6666666666666667No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT10.6666666666666667No Hit
GGGCAATGGCCTTCTCGATGTCCACCAACTCTGTCTCATAGAT10.6666666666666667No Hit
CGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCAAAGCCTCCCACC10.6666666666666667No Hit
GATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCC10.6666666666666667No Hit
CCGGATTGCAGCAGCGCCTTGGTGATGGCGAGGATGCTGTCTC10.6666666666666667No Hit
CCTATTTAGCTGTTCCCCAACCTTTTCCTCCGACCCCCCAACA10.6666666666666667No Hit
GTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAG10.6666666666666667No Hit
GTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCT10.6666666666666667RNA PCR Primer, Index 21 (96% over 27bp)
TCCTTTCTGTTCCTCTCAAGATGCTTTCGAACAGCAACTGCTT10.6666666666666667No Hit
GAGGGAACCAACTTCAGAACAGTTTTAGATAAAGCTGTGCAGG10.6666666666666667No Hit
AGTCTGGAGAGCTGCATGGGCTCACAACTGAGGAGGAATTTGT10.6666666666666667No Hit
GCTTCCTACTTTTCAGGTTTAAATTTATCTTTTTTCTTCTAAA10.6666666666666667No Hit
GTTCCTGGACGTGTACAAGAACTGCAACGGGGTGGTCATGATG10.6666666666666667No Hit
AGATATACTCGAGCTTGTACTTGGTCATTGAACCTCTCTGTTG10.6666666666666667No Hit
ATAGAAGAACTGGTAGCCACAGTGGTGAAATTGGAAAGAGAAC10.6666666666666667No Hit
TTTTTTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACAC10.6666666666666667No Hit
GTATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTG10.6666666666666667No Hit
GAACTATTTGTAGAGCGCACGGGAAGATAAATGGCGCTTCTTG10.6666666666666667No Hit
AATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAA10.6666666666666667No Hit
CTGCTGCCTGCTGATCCGCGCCTAGAGTTTGACCAGCCACTCT10.6666666666666667No Hit
GTGATAATGAAAGCTAAGCCTCGGGCTAATTTCCCCATAGCCG10.6666666666666667No Hit
GCTGTTTGCTAGTCAATGTGCCTTCTCTGATGTTCTACAAGGA10.6666666666666667No Hit
GTACACAAAAATGCACATGCTGTGAGCTCGATGAGTAGGGCGG10.6666666666666667No Hit
GAGTGAGACTCTCTCAAAAAAAAAAGAATCATGACACAAGTAT10.6666666666666667No Hit
AGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCAC10.6666666666666667No Hit
GCGGCGGCGTCGGCGGCGGCGGGACCGAAACCCCCCCCGAGTG10.6666666666666667No Hit
CTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGACCTGCCCGTGAAGAGGC10.6666666666666667No Hit
TGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGCT10.6666666666666667No Hit
CTCCTGGGCAAGCGCCCCCACCCCCAGGGAACAAGGTCCAGGC10.6666666666666667No Hit
CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGG10.6666666666666667No Hit
GTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATACTCCACTGCTT10.6666666666666667No Hit
GCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGC10.6666666666666667No Hit
CACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCCTGTCTCTTAT10.6666666666666667No Hit
GTCTTGAATATATGAAGAACTCTTACAACTCAATAATAAAAAG10.6666666666666667No Hit
GTATATAGCTTATTTGGTGAATCTTCATCCTCATTACGTTTTC10.6666666666666667No Hit
ACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTT10.6666666666666667No Hit
AACTAGCAGAGCCGTTCGAGCCAAGGACGCAGGGTTGAATCTG10.6666666666666667No Hit
GAGTCTCGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAA10.6666666666666667No Hit
CTACAATGCCACGCAGAAGGGCCATGTGCCACATTACTTGTTG10.6666666666666667No Hit
GGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGCTGCAGTT10.6666666666666667No Hit
CTCTACCTAGTGTGCGGGGAACGAGGCTTCTTCTACACACCCA10.6666666666666667No Hit
GGCCAACAGTCTCTGCTTCTTCTCTTGCTTTGTCTCTGGTCTG10.6666666666666667No Hit
ATACCAAACGACGAGCGTGACACCAAGATGCTGTCTCTTATAC10.6666666666666667No Hit
AGATAGACGACCACAGCCTGTGCACCCGCAGGAAGTAAAATCC10.6666666666666667No Hit
GTTTCCTTCCACTGCAGTGTGTCTTTCTCACAGATGGAGAGTC10.6666666666666667No Hit
GAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCCCTTAA10.6666666666666667No Hit
TTTTTTTTTTGCCTAGTTCCTTCACCCGAGTTCTCTCAAGCGC10.6666666666666667No Hit
GGAAGATGCTCAACACCTCCTCCTTGCTGGAGCAGCTGAACGA10.6666666666666667No Hit
GTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGTGGCATTCTTCCACGA10.6666666666666667No Hit
GGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATACTAACA10.6666666666666667No Hit
ACCTAGCCCCAAACCCACTCCACCTTACTACTAGACCTGTCTC10.6666666666666667No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACGGGCACTCCGTCATCTTTAGTGGCC10.6666666666666667No Hit
CAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGC10.6666666666666667No Hit
GTTCTACAGCACACTACCAGAAGACAGCAGAAATGAAAAGCAT10.6666666666666667No Hit
CTGTAGAAAGCTGTCATTTGATTTTGATTATGTAGTTCATCCA10.6666666666666667No Hit
TGCTGGTAGTTGCTCGCCATCCAGTACAGATCCTCGAGGTGTG10.6666666666666667No Hit
TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT10.6666666666666667No Hit
CGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGTTGGCACGGAGTTA10.6666666666666667No Hit
CCGCTGGCCAGCAGGCACACAGGGCACGGCGCTCTGCCTGTCT10.6666666666666667No Hit
CGGCGCGACCGTTGCGGGTGAAGATGGCCACGCCATTGCCGTA10.6666666666666667No Hit
TCTCCGAGCCCACGAGACTCCTGAGCATCTCGTATGCCGTCTT10.6666666666666667RNA PCR Primer, Index 26 (100% over 22bp)
CGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCG10.6666666666666667No Hit
AACAAATGCCCTGCTTCCAGGAAAAGCCTCTAAGCCTGTCTCT10.6666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT10.6666666666666667No Hit
ATTCAATTCAGAACCACCGTGAACCAAGATCTCTGGAAACAAA10.6666666666666667No Hit
GTGTTTCGACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGA10.6666666666666667No Hit
TCATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGC10.6666666666666667No Hit
TTACTAGAGTCACTATCCGGAAATCTAAGAATATCCTCTTTGT10.6666666666666667No Hit
ACATTGTGAATGTATAAAGTGCCACCTAAACTGTTTACTTTAA10.6666666666666667No Hit
CTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCT10.6666666666666667No Hit
CTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAAC10.6666666666666667No Hit
TATTGTGAGCTCGATGAGTAGGGCGGGACACATGGTATCCTGT10.6666666666666667No Hit
GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAA10.6666666666666667No Hit
ACCTTCCCGAGGCCAGGCTGTGGCCTGCTCGCTACGTGTTGCA10.6666666666666667No Hit
TCTATACACTCACTACCGCTACCACTTACCACCACCAACGAAA10.6666666666666667No Hit
GAGTCCTGTATTGTTATTTTTCGTCACTACCTCCCCGGGTAGG10.6666666666666667No Hit
CCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAACTGTCTC10.6666666666666667No Hit
GGAGAGCCTTGAATATTTCACTTTACTACTGGGGATTCCAGTA10.6666666666666667No Hit
GCTGTAGCCAGACTGCCTCTCTAGATTCCTCCTCTCTGGGCAG10.6666666666666667No Hit
GTCTTAAAATGAGTGAAAACAGAAACACAACATATAAACTGTC10.6666666666666667No Hit
CACTTGTAGAGCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.6666666666666667No Hit
CGTCATCACGCCTCAGCCTTGATTTTCCGGATTTGCCTGGAAA10.6666666666666667No Hit
GTCCTAACCACTTCGGTGGTAGGAGGAGTGGGAGAGGCTCCTT10.6666666666666667No Hit
CATCCTGGCTGTCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAAC10.6666666666666667No Hit
CCTAAGAGCAGCAGATCTAACTTGGAACGTCTCAACCATGGGT10.6666666666666667No Hit
GGCCTGTCAGCACTATGGCCTGACTTTCCGCAGGCCCCGTGGA10.6666666666666667No Hit
TGTCTACCCTTCCTCAACCCGAGACCCTAGTGCCTCTAACGGA10.6666666666666667No Hit
GGATTGACTCTCTGAAGCTAGGCTTTGTAAATCACTAGATACC10.6666666666666667No Hit
TCTTTAGTGACCATGAAGTGCGATTGCCTCGGTGATAACGCTG10.6666666666666667No Hit
CTTCATGGTCACTAAAGATGACGGAGCCCGTACTCTGCGTTGA10.6666666666666667No Hit
GATGGACCAGGCTCTTGTTGGGATGTGCGTAAACGAGAGACGT10.6666666666666667No Hit
CTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCCTGTCTC10.6666666666666667No Hit
CCATTGCACTCTTCATATGTCCTGTAGACACTATGAATAAAGG10.6666666666666667No Hit
CGCTACGACTTCTCGCCGGAGATCGCCGTCCGCGGCACGGCCT10.6666666666666667No Hit
TGCCTTTGTATAGGGCCAAAAGAGAAACATTGGCTACTTTGAC10.6666666666666667No Hit
GGAGGAAGAGCTGGACGAAGCCGTGGAGAGAAGCCTGAAAAGC10.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers